Черноморский филиал Московского государственного университета им. М. В. Ломоносова был создан 29 марта1999 года по инициативе мэра Москвы Ю.М. Лужкова и ректора МГУ В.А. Садовничего на основании Решения Ученого Совета МГУ. Это решение было согласовано с правительствами России и Украины. Огромную поддержку в создании филиала (как организационную, так и финансовую) оказало правительство г. Москвы. Еще 5 февраля 1999 года мэр Москвы Ю.М. Лужков издал Распоряжение "О вопросах создания Черноморского филиала МГУ им. М.В. Ломоносова". С тех пор и по сей день Московское правительство играет решающую роль в создании и приумножении материальной базы филиала. Практическую реализацию проектов строительства учебного и лабораторного корпусов, общежитий, столовой, Дома культуры и спорткомплекса осуществляет строительное управление Черноморского флота России. 

   Перечень факультетов:
- Компьютерной математики;
- Естественных наук;
- Историко-филологический;
- Экономики и управления;
- Психологии.