В музее 7 экспозиционных залов, в четырех из которых размещена постоянная экспозиция. 3 зала отведены под временные выставки.

Экспозиция музея знакомит посетителей с жизнью и творчеством И.С. Шмелёва в дореволюционные годы в Москве, годы гражданской войны в Алуште, затем в эмиграции во Франции. В фондах музея имеются подлинные письма И.С. Шмелёва; фотографии, переданные дочерью бывшего генерала царской армии А.И. Деникина М.А. Деникиной (Грей), семьей крымских караимов Дуван-Гелеловичей; газеты и книги из личной библиотеки писателя; гравюры художника Ф. Домогацкого; картины М. Сапожникова, В. Павловой, В. Карпущенко; иконы 19-20 вв.; мебель и предметы эпохи начала 20 века.

Сегодня музей писателя И.С. Шмелёва обладает уникальным архивом современных научных исследований творчества писателя.