С тюркского Эмине - женское имя, байюр - холм и Коба - пещера. В переводе - «Пещера Эмине-Баир». Пещера расположена 2-х км южнее села «Мраморное», на нижнем плато массива горы Чатыр-Даг. О пещере давно знали и посещали ее пастухи и охотники. Но впервые в литературе ее описание появилось в 1927 году (Н. Лебедев, журнал «Крым»). Он же упомянул, что вход в пещеру открывается тремя отверстиями. Отсюда и название «Трехглазка».

Среди туристов она известна и как «Ноздря». Длина пещеры достигала 130 м по измерениям Н. Лебедева. Автор открыл и впервые описал одного из обитателей пещеры - лжескорпиона, небольшого бесцветного паучка. Потом эту пещеру описывал Васильевский и Желтов (1932г.), а позже ее характеристика появилась в материалах карстовой экспедиции (Дублянский, 1964). К тому времени ее длина составляла 240 м, глубина 63 м. Затем крымским спелеологам удалось проникнуть в труднодоступные продолжения пещеры. Однако к настоящему времени большая часть пещеры остается недоступной для широкого посещения. Экскурсионная часть ограничена первыми двумя сотнями метров.

Вход в пещеру расположен на местном водоразделе между двумя воронками. Пещера углубляется на север, под верховья балки, которая круто спускается в сторону Аянского водохранилища. Воронки на поверхности балки на склонах массива - принадлежность современного рельефа, не связанные с самой карстовой полостью. Последняя сформировалась в другую геологическую эпоху и в иных природных условиях. «Эмине-Баир-Коба» входит в группу рядом расположенных пещер, куда входят также «Мраморная» и «Эмине-Баир-Хосар». Скорее всего эти пещеры образовались под воздействием одного и того же водного потока, со стороны южных гор, ныне ушедших под воды Черного моря.

Этот огромный поток либо разделялся на три отдельные рукава, которые образовали пещеры указанной группы, либо, что более вероятно смещались последовательно с запада на восток, формируя по пути указанные пещеры. Удивительное зрелище представляло плато Чатыр-Дага в среднем-позднем плиоцене (10-12 млн. лет назад). Огромная река, от которой остались только следы в виде остатков русла, текла по поверхности средней яйлы. Чудовищные силы ломали жесткую громаду известняков. В трещины с ревом устремлялись воды поверхностного потока, растворяя и размывая породу, оставляя за собой огромные залы, переходы и мелкие каверны. Затем процессы воздымання затихали.

Воды спокойнее потекли по подземным руслам, при этом, не только растворяя известняк, но и откладывая уже растворенный материал в местах, где резко менялись температура и содержание углекислоты в воздухе. Затем снова земная твердь поднималась, лопаясь и оседая. В некоторых пещерах при этом рушилась кровля, запруживая подземные потоки. А чаще всего вода уходила из древних русел все ниже и ниже, стремясь к самому глубокому уровню (базису карстования). Результаты всех этих процессов заметны внутри пещеры. Начинается она огромным порталом - аркой, размером 4 х 6 м. Привходовая часть площадью 50м2 прилегает с юга.