Был открыт в 1871 г. В 1919-1920 гг. в здании Семинарии преподавал выдающийся русский философ, профессор богословия и политэкономии Таврического университета С.Н. Булгаков.

Сегодня здесь действует Симферопольское Духовное Училище. В 1901 г. началось строительство новой семинарской церкви, а через два года в нововозведенном Храме Трех Святителей - Василия Великого, Иоанна Златоуста и Григория Богослова - покровителей христианского образования, состоялось первое богослужение. В годы советской власти в храме размещались архив и книгохранилище. Ныне храм открыт для прихожан.